แม้ว่าจิตรกรรมวัดอุโมงค์จะมีความสำคัญเป็นอย่างยิ่ง แต่คุณค่าดังกล่าวได้ถูกมองข้ามไป ด้วยมีความคิดทั่วไปว่า งานจิตรกรรมแห่งนี้อยู่ในสภาพลบเลือนจนไม่สามารถสังเกตเห็นร่องรอยใดๆ ได้อีกแล้ว แม้จิตรกรรมดังกล่าวจะอยู่ในสภาพที่ชำรุดและลบเลือนมากในปัจจุบัน อันทำให้เป็นอุปสรรคที่ยากแก่การสังเกตลวดลายและเรื่องราวในภาพจิตรกรรมฝาผนังได้ แต่จากการปฏิบัติงานของโครงการตลอดระยะเวลาที่ผ่านมา ก็สามารถฟื้นภาพจิตรกรรมฝาผนังที่ลบเลือนเหล่านั้นจนกระทั่งเห็นถึงสภาพของจิตรกรรมฝาผนังก่อนการชำรุดขึ้นมาได้อีกครั้งหนึ่ง โดยสามารถบันทึก และรักษาหลักฐานงานจิตรกรรมที่สำคัญไว้ก่อนที่จิตรกรรมวัดอุโมงค์จะลบเลือนหมดสิ้น

      ด้วยตระหนักถึงความสำคัญของงานจิตรกรรมฝาผนังแห่งนี้ทางโครงการจึงได้ดำเนินการคัดลอกจิตรกรรมฝาผนังวัดอุโมงค์ เพื่อการอนุรักษ์งานจิตรกรรม และเผยแพร่คุณค่าของงานจิตรกรรมแห่งนี้ออกสู่สังคม